《办法》共分6章16条，明确了各级管理机构的职责和任务，规范了国家重点林木良种基地申请与确定程序：由林木良种生产单位提出申请、省级林业主管部门审核推荐、国家林业局评审确定产生。

    《办法》规定，国家重点林木良种基地申请单位需具备8个基本条件：基地自然条件适合建设树种生长发育，区域布局合理，当地或生态条件相似地区对选育树种的种子（穗条）、苗木有长期或潜在的需求；对选育树种开展了系统研究，收集保存了丰富的育种资源，且保存完好；具备一定生产规模和发展潜力，生产用地规模不少于20公顷且不能为租赁土地；机构健全，人员配备合理，具备一定技术力量，专业技术人员不少于2人；建设与管理规范，各项管理制度健全，档案资料齐全且保存完整；重视生产与科研相结合，与科研、教学单位有长期合作关系，有技术力量较强的单位作为科技支撑单位；具有《林木种子生产许可证》、《林木种子经营许可证》；经省级林业主管部门确定为“省级重点林木良种基地”1年以上。

     根据《办法》，各省林业主管部门必须定期对基地进行检查，国家林业局将不定期地组织人员对国家重点林木良种基地进行抽查，并对基地存在的问题提出意见。